(注)以下の情報は、「轢断のシバタ」先生から御提供頂いた情報です。
■SARS-CoV-2(武漢由来のオリジナルの新型コロナ)の全ゲノム情報です(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/1798174254)
■スパイクタンパク質の形です(https://numon.pdbj.org/mom/246?l=ja)
■こちらはSARS-CoV-2のゲノムの解説です。この中のGene Sがスパイクタンパク、もしくはサーフェイスタンパクと呼ばれる物です。(https://plaza.umin.ac.jp/~OIO/blog/2020/05/23/full-genome-sequence-of-sars-cov-2/)
■下記が、S protein(spike protein, surface protein)のDNA配列とされる全長です。
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上記のDNA配列をアミノ酸配列に翻訳すると下記のMFVFから始まる配列が得られます。それ用のソフトウェアや専用のホームページなど一瞬で変換されます。
この配列から立体構造を専門のソフトでシミュレーションした結果に得られた前述の画像などが、皆さんがニュースで見たことのあるスパイクタンパク質の絵です。
皆さんの身体にmRNAワクチンまたはウイルスベクターワクチンが投与されると、体内で下記のアミノ酸配列(=SARS-CoV-2のスパイクタンパク)の全部or一部が合成されます。
これに免疫系が反応して抗体が作られることになります。
MFVFLVLLPLVSSQCVNLTTRTQLPPAYTNSFTRGVYYPDKVFRSSVLHSTQDLFLPFFSNVTWFHAIHVSGTNGTKRFDNPVLPFNDGVYFASTEKSNIIRGWIFGTTLDSKTQSLLIVNNATNVVIKVCEFQFCNDPFLGVYYHKNNKSWMESEFRVYSSANNCTFEYVSQPFLMDLEGKQGNFKNLREFVFKNIDGYFKIYSKHTPINLVRDLPQGFSALEPLVDLPIGINITRFQTLLALHRSYLTPGDSSSGWTAGAAAYYVGYLQPRTFLLKYNENGTITDAVDCALDPLSETKCTLKSFTVEKGIYQTSNFRVQPTESIVRFPNITNLCPFGEVFNATRFASVYAWNRKRISNCVADYSVLYNSASFSTFKCYGVSPTKLNDLCFTNVYADSFVIRGDEVRQIAPGQTGKIADYNYKLPDDFTGCVIAWNSNNLDSKVGGNYNYLYRLFRKSNLKPFERDISTEIYQAGSTPCNGVEGFNCYFPLQSYGFQPTNGVGYQPYRVVVLSFELLHAPATVCGPKKSTNLVKNKCVNFNFNGLTGTGVLTESNKKFLPFQQFGRDIADTTDAVRDPQTLEILDITPCSFGGVSVITPGTNTSNQVAVLYQDVNCTEVPVAIHADQLTPTWRVYSTGSNVFQTRAGCLIGAEHVNNSYECDIPIGAGICASYQTQTNSPRRARSVASQSIIAYTMSLGAENSVAYSNNSIAIPTNFTISVTTEILPVSMTKTSVDCTMYICGDSTECSNLLLQYGSFCTQLNRALTGIAVEQDKNTQEVFAQVKQIYKTPPIKDFGGFNFSQILPDPSKPSKRSFIEDLLFNKVTLADAGFIKQYGDCLGDIAARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDEMIAQYTSALLAGTITSGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKLIANQFNSAIGKIQDSLSSTASALGKLQDVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQSAPHGVVFLHVTYVPAQEKNFTTAPAICHDGKAHFPREGVFVSNGTHWFVTQRNFYEPQIITTDNTFVSGNCDVVIGIVNNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYIWLGFIAGLIAIVMVTIMLCCMTSCCSCLKGCCSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT